元朗东区（图）
元朗区东部有两条主要水道，即锦田河和牛潭尾主要排水道，和数条较细小的河溪，分别流经新田(例如石湖围及麒麟村等地方)和打石湖。
上述各水道所受污染，主要是不时来自附近禽畜饲养场的非法排放，以及集水区内个别未接驳污水渠的屋宇。
禽畜农场主要集中于锦田河的集水区、石湖围以及麒麟村一带。
锦田河
锦田河是元朗东部最大的天然排水系统，部分河段因防洪工程而扩阔和铺上混凝土。锦田河全长50公里，集水区的面积约为44平方公里，范围由北面的鸡公岭至东面的大刀屻，而东南面则伸延至大帽山。锦田河由东南面流向西北面，主要有南北两大支流。两条支流在近高埔村处汇合，然后流入连接后海内湾的主排水渠。支流下游于汇合点前筑有两道充气水闸作为防潮屏障。水闸上游的河水由渠务署的抽水站抽入下游。该两个水闸下游河段的水位会随潮汐涨退而升降。锦田河的其中一个污染源可能为附近禽畜饲养场的排放物。
牛潭尾主要排水道
牛潭尾主要排水道属河道疏浚工程项目之一，用以改善元朗、锦田和牛潭尾流域中下游的严重泛滥问题。上游及下游部分的工程已分别于二零零三年及二零零五年完成。该排水渠由东流至西，集水区约为10平方公里。排水渠下游末端筑有一个充气水闸，用以防止潮水流入排水渠。集水区内水道的主要污染源，可能是禽畜饲养场和未有接驳污水渠的乡村的排放物。
新田
新田是新界西北一个广宽而日渐都市化的区域，范围由北面的深圳河至东面的落马洲及东南面的麒麟山，而西面则伸延至米埔。其内分布有多条乡村，俱没有接驳污水渠设施；而大部分禽畜农场则集中于区内的南部，如石湖围及麒麟村。新田区没有大河，但有几条小溪流，分别流经石湖围及麒麟村。禽畜废物是溪流的主要污染源。
